Resultados de aprendizaje

Al final de este curso, podrá: Explicar los detalles de la tecnología de secuenciación de ARN paso a

• paso
• Resumir algunos conceptos y descripciones básicos sobre los diferentes tipos de ARN Describir las bases de datos que contienen lecturas de RNA-Seq
• y descargar estos datos sin procesar Evaluar la calidad general de las lecturas de RNA-Seq sin procesar
• con la herramienta FastQC en términos de varios parámetros
• Explicar en detalle las principales partes y características de un archivo FASTQ Aplicar el procedimiento de recorte a las lecturas de RNA-Seq
sin procesar utilizando
• Herramienta Trimmomatic para quitar
adaptadores
• Genere archivos de alineación (archivos SAM y BAM) después de mapear las lecturas de RNA-Seq corregidas al genoma de referencia
• Calcule el número de lecturas alineadas (mapeadas) para cada gen con la herramienta HTSeq
• Explique las principales partes y características de un archivo SAM (mapa de alineación de secuencias) en detalle