Diploma em Análise e Aplicações de Redes Metabólicas

bioenergética é a soma dos processos de transformação de fontes externas de energia em trabalhos biologicamente úteis dos sistemas vivos e o processo de armazenamento e consumo da energia na forma de trifosfato de adenosina (ATP). Neste curso, você estudará bioenergética e como ela destaca as necessidades de energia celular para a síntese de biocombustíveis. O rendimento de carbono celular e a eficiência energética e o processo de formação de ATP a partir da cadeia de transporte de elétrons serão discutidos. A anotação unidimensional das sequências do genoma destacará os procedimentos para localizar os quadros de leitura abertos (ORFs) e atribuir funções aos produtos gênicos. Da mesma forma, os sistemas bidimensionais cobrirão mecanismos de reação, redes regulatórias e redes de sinalização, etc. Você examinará o processo de reconstrução da rede bioquímica e a hierarquia de quatro níveis para simplificar a conceituação das funções da rede. Em seguida, o modelo metabólico em escala de genoma e a representação matemática das redes bioquímicas serão elucidados. Aprenda os métodos para definir um limite de rede, bem como os modelos matemáticos para estimar um mapa de rede e uma matriz estequiométrica

Em seguida, descubra a definição e os procedimentos matemáticos para formular uma função objetivo. Os sistemas para avaliar a sensibilidade das propriedades ideais de uma rede (também conhecidos como análise de robustez) serão abordados. O módulo sobre análise do plano de fase considera as características e os sistemas matemáticos para estimativas de valor das quatro regiões isoclinas de uma rede metabólica. Examine a amostragem aleatória e os procedimentos de ataque e execução centrados artificialmente (ACHR) para caracterizar e estimar o centro de um espaço de solução de fluxo. Da mesma forma, o módulo sobre design computacional de cepas mutantes dissecará optknock, optstrain e outras estratégias de desenvolvimento de cepas. Aprenda sobre a base convexa do espaço nulo, dos modos elementares e dos caminhos extremos. Além disso, as técnicas de rotulagem 13C, as etapas de formulação do 13C MFA e os desafios do MFA assistido por 13C serão destacados. Os sistemas para impressão digital 13C e análise de fluxo metabólico não estacionário (NMFA) serão discutidos. Em seguida, as aplicações da engenharia metabólica no design de cepas microbianas são examinadas. O módulo sobre tecnologia de edição de genoma destaca várias ferramentas e estratégias genéticas empregadas para modulação da expressão gênica e otimização da via metabólica. Você aprenderá sobre promotores, sítios de ligação ao ribossomo (RBS), sistemas de modulação gênica mediados por RNA,

Finalmente, os recursos interessantes e os cronogramas básicos da tecnologia CRISPR serão examinados. Aprenda sobre a matriz CRISPR, a estrutura do locus CRISPR e os estágios da imunidade adaptativa CRISPR-Cas. Além disso, a base da ferramenta de engenharia Cas9, além das vantagens do CRISPR-Cas9 em relação a outras ferramentas convencionais, é destacada. Você verá como classificar os produtos químicos produzidos por microrganismos de bioengenharia (também conhecidos como fábricas de células microbianas). Em seguida, serão identificadas as fábricas microbianas para produção de etanol hemicelulósico em leveduras e produção de bioetanol lignocelulósico em E. coli. Da mesma forma, as estratégias e aplicações da engenharia metabólica na produção de aminoácidos serão divulgadas. Quais são os estados funcionais das redes biológicas? Como as informações obtidas das redes de reação podem ser apresentadas em uma estrutura matemática? Essas questões serão abordadas neste curso e as soluções práticas serão reveladas. Se você quer uma carreira em biologia de sistemas, engenharia metabólica ou disciplinas relacionadas, então você achará este curso empolgante e gratificante. Sua aplicação do conhecimento adquirido nessas disciplinas pode levar a melhorias no desenvolvimento de metabólitos e produtos naturais para as indústrias farmacêutica, de bioenergia ou biotecnológica