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Analisi e applicazione Flux metaboliche

Studiare i metodi a base di vincolo per l'equilibrio flux, la variabilità e l'analisi delle dipendenze in questo corso online gratuito.

Publisher: NPTEL
In questo corso gratuito online si imparerà sui metodi a base di vincolo e sulle procedure per alterare i fenotipi cellulari. Studiare il protocollo di analisi 13C flux, le procedure per la formulazione di MFA, nonché le importanti applicazioni di 13C MFA. Completando questo entusiasmante corso, si acquisirà alto nella richiesta conoscenze tecniche per una carriera gratificante nella biologia dei sistemi e nell'ingegneria metabolica. Allora, perché aspettare? Iscriviti ora!
Analisi e applicazione Flux metaboliche
  • Durata

    5-6 Oras
  • Students

    21
  • Accreditation

    CPD

Descrizione

Modules

Risultato

Certificazione

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Description

Sapevate che esiste una tecnica matematica per misurare il diametro, l'area, la portata (flussi) e altre proprietà fisiche del globulo rosso? Ancora più emozionante è che, come i modelli finanziari di contabilità ed economia, gli ingegneri metabolici possono adottare i concetti di prezzo e derivati dei costi per risolvere le sfide dei sistemi metabolici. In questo corso gratuito online si esaminerà la funzione oggettiva che definisce il problema di ottimizzazione del bilanciamento del flux e come può essere utilizzato per identificare soluzioni ottimali. Si studierà la formulazione matematica delle funzioni oggettive da semplici esempi, che considereranno l'utilizzo di quattro flussi metabolici per massimizzare la produzione di ATP. Vedrete l'insieme equilibrato di richieste metaboliche che costituiscono la funzione di crescita di un sistema microbico. Scopri una terminologia importante conosciuta come &ld'andamento dei prezzi ombra e le sue essenze in soluzioni ottimali di interpretazione, e decisionale. Poi, verrà mostrato come si tenta di affrontare due domande di programmazione lineare: In che misura si possono alterare i flussi metabolici? Quali saranno gli effetti di flusso che alterano i processi cellulari di interesse, tra cui la crescita e la formazione dei prodotti? Allo stesso modo, identificherà la definizione e le applicazioni di analisi dei costi ridotti. Poi verrà presentata una revisione sintetica dei prezzi dell'ombra e dei costi ridotti.

Prossimo articolo sull'analisi della robustezza esaminerà la sensibilità delle proprietà ottimali di una rete utilizzando i parametri ambientali e genetici per il calcolo degli stati ottimali. Si valuteranno le quattro regioni isocline del piano di fase fenotipo (PhPP) e l'effetto della variabilità dei loro valori alfa (∞ - valore) sulla funzione oggettiva. Saranno evidenziate le caratteristiche degli aerei di fase, comprese le regioni infeasibili e futili, la linea di ottimizzazione e, l'ottimizzazione delle biomasse tramite l'analisi del bilanciamento del flux (FBA). Poi, i metodi per caratterizzare gli spazi di soluzione metabolica, e gli effetti dei vincoli imposti saranno studiati tramite analisi di estrema patologia e tecniche di campionamento randomizzate. Verranno trattati i metodi computazionali per la progettazione di ceppi mutanti, così come le dichiarazioni dei problemi di ogni modello. Allo stesso modo verranno presentati i quattro sistemi di stepwise per il design del ceppo (noto anche come optstrain). Si discenderà lo sviluppo del paradigma di pathway basato su netfunzionato considerando come gli avanzamenti nelle tecnologie biochimiche abbiano impattato positivamente la stoichiometria metabolica e l'annotazione del genoma. L'argomento su Linear Basis for Null Space eluciderà le dimensioni, la matrice stoichiometrica e le proprietà di soluzione di flusso steady-state del soggetto. Si esamineranno i percorsi estremi, nonché il loro significato in analisi convessa, applicazione nelle disuguaglianze e negli studi di equitazione lineare, ecc. Studiare la definizione di uno spazio convesso e le distinzioni tra gli spazi lineari e convessi.

Inoltre, saranno delineate le caratteristiche distintive dell'analisi convessa e della biologia cellulare, nonché i tre tipi di percorsi estremi. Imparerai le modalità elementari, la soluzione convessa e i core di scambio, ed esamina il loro rapporto con la distribuzione flux e i confini di sistema di una rete metabolica. La tecnica 13C utilizzata per quantificare i flussi intracellulari durante l'analisi del flusso metabolico (MFA) sarà divulgata. Allo stesso modo verranno presentati i passi cruciali in 13C MFA formulazione e sperimentazione, così come le sfide di MFA assistita da 13C. Verranno discussi anche i concetti di derivatizzazione chimica, 13C di impronte digitali, nonché importanti casi di studio di casi delle applicazioni di MFA. Cosa significa il campionamento di uno spazio? Come si può scegliere la funzione oggettiva? Queste domande saranno affrontate in questo corso e i fatti che li circondano saranno considerati. Se state cercando un percorso di carriera nella biologia computazionale, nell'ingegneria metabolica o nei campi correlati, allora, troverete questo corso entusiasmante e gratificante. La vostra applicazione delle conoscenze acquisite in questi soggetti porterà di conseguenza a miglioramenti nello sviluppo di metaboliti naturali e prodotti per le industrie farmaceutiche, bioenergetiche, biochimiche o biotecnologiche. Allora perché aspettare? Inizia questo corso oggi!

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